作废发票多种多样，对不同的作废发票，应当采取不同的管理方法：

(1)开具发票过程中出现的作废发票的管理。对由于开票人员工作失误或其他原因开错的发票，应当在发票上加盖“作废”戳记，重新开具发票，不得在开错的发票上涂改。开错的“作废”发票必须全部联次妥善保管，粘贴在原发票存根上，不得私自销毁，以备查核。

(2)政策调整或变化造成作废发票的管理。税务机关实行发票统一换版或政策变化以后，一般规定一个过渡期，在过渡期内，新旧发票可以同时使用，到期后，旧版发票应当在税务机关收缴完毕以后，指定专人集中保管，并登记清册，经办人员和负责人签字后，统一销毁。增值税专用发票的销毁须报经省国税局批准。